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비상장주식 양도소득세율 25년 총정리|절세·세금·비상장주식 체크포인트

by 제제t 2025. 11. 19.

    [ 목차 ]

비상장주식 매도 시 세금 부담과 신고 요건을 정확히 이해해야 절세 효과를 누릴 수 있습니다.


1. 비상장주식 양도소득세율 2025 핵심 개요

비상장주식(상장되어 있지 않은 기업의 주식)을 양도할 때 적용되는 양도소득세율은 상장주식보다 복잡하고 조건이 많습니다. 2025년 현재 이 세율 체계에는 ‘소액주주 vs 대주주’, ‘중소기업 여부’, ‘보유기간’, ‘양도차익 규모’ 등이 영향을 미칩니다.

 

특히 비상장주식 거래는 일반 장내주식에 비해 거래 투명성이 낮고 가치평가가 까다로워 세무 리스크가 상대적으로 크므로 사전에 구조를 이해하는 것이 매우 중요합니다.


2. 비상장주식 양도소득세율 적용대상 및 기본 구조

2-1. 과세대상 정의

비상장주식이 양도소득세 과세대상에 포함되는 조건은 다음과 같습니다.

  • 주권이 상장되어 있지 않은 법인의 주식
  • 장외거래 또는 사모거래 형태로 양도되는 주식
  • 소액주주라도 ‘중소·중견기업이 K-OTC(한국장외주식시장) 등을 통해 거래한 경우’ 일부 면제 요건이 존재함. 
  • 즉, 비상장주식이라면 원칙적으로 양도소득세 과세 대상으로 보고 준비해야 합니다.

 

2-2. 대주주 구분 및 소액주주 구분

세율 적용의 핵심 기준은 ‘대주주 여부’입니다. 대주주는 지분율 및 시가총액 기준을 충족하는 주주를 말하며, 비상장주식의 경우 지분율 4% 이상 혹은 시가총액 기준 10억원 이상 등이 대주주 판단 기준으로 적용되고 있습니다. 

소액주주는 이러한 대주주 기준에 미달하는 주주로, 통상적으로 낮은 세율이나 면제 가능성을 갖습니다.

2-3. 양도차익 산출 및 세액 산정 개요

양도차익 = (양도가액 – 취득가액 – 필요경비)

기본공제 등이 적용되는 후, 해당 양도차익에 세율을 곱해 납부할 세액이 결정됩니다. 

비상장주식 거래 시에는 별도의 장외시장 특성, 평가가액 산정 등이 변수로 작용하기 때문에 ‘필요경비 인정 여부’, ‘취득가액 명확성’ 확인이 중요합니다.


3. 비상장주식 양도소득세율 2025 상세 세율 현황

3-1. 소액주주(비대주주) 비상장주식 세율

  • 중소기업 해당 비상장주식인 경우: 10% 세율 적용. 
  • 그 외 비상장주식(중소기업이 아닌 법인 등): 20% 세율 적용. 
  • 즉, 비상장주식을 매도하는 개인이라면 본인이 ‘중소기업 주식 보유 여부’와 ‘대주주 여부’를 먼저 확인해야 합니다.

3-2. 대주주 비상장주식 세율

  • 대주주가 1년 미만 보유한 중소기업 외 법인의 비상장주식을 양도하는 경우: 30% 단일세율 적용. 
  • 대주주가 1년 이상 보유한 경우 과세표준 3억원 이하: 20% 세율
  • 과세표준 3억원 초과시: 6천만 원 + (3억원 초과액 × 25%) 방식 적용. 
  • 예컨대 대주주가 보유한 비상장주식을 매도해 양도차익이 4억 원이라면, 과세표준 3억원까지 20%, 나머지 1억원에 대해 25% 적용, 누진공제 구조에 따라 실제 세액이 계산됩니다.

3-3. 보유기간 및 추가조건

보유기간이 1년 미만인 경우에는 일반보다 세율이 높게 적용되며, 특히 대주주인 경우에는 30%까지 적용되는 예가 있습니다. 

또한 조건에 따라 중소기업 여부, 벤처기업 여부, K-OTC 거래 여부 등이 세율이나 면제 여부에 영향을 줄 수 있습니다. 


4. 비상장주식 양도소득세 신고 및 납부 절차 2025 체크포인트

4-1. 신고기한 및 납부기한

비상장주식을 양도한 경우 양도일이 속한 반기의 말일로부터 2개월 이내에 신고 및 세액을 납부해야 합니다. 예컨대 5월에 양도했다면 6월 30일이 속한 반기의 말은 6월 30일, 이로부터 두 달 내인 8월 31일까지 신고해야 합니다. 

4-2. 필요서류 및 증빙자료

  • 주식 양수도계약서
  • 양도금액 입금 내역 혹은 대금 이체 확인 자료
  • 취득가액을 증명할 수 있는 자료(매수계약서, 증여가액 신고 자료 등)
  • 필요경비 적용 자료
  • 보유기간, 지분비율 등 대주주 여부 증빙자료
  • 위 증빙자료가 미비하면 과세관청의 추정가액 적용 또는 가산세 등이 부과될 수 있으므로 준비가 필수입니다.

4-3. 연말·연초 주의사항

  • 연말 보유지분 조정: 대주주 판정을 회피하기 위해 연말 전에 일부 주식 매도하거나 지분을 줄이는 전략이 활용됩니다. 
  • 장외거래 및 비상장시장에 대한 국세청 감시 강화: 최근 비상장주식 거래가 증가함에 따라 신고 누락 리스크가 커졌습니다.
  • 양도차익이 없는 경우에도 ‘양도’ 자체가 신고 대상이 될 수 있으며, 신고 누락 시 가산세 또는 추징세 대상이 됩니다. 

5. 비상장주식 양도소득세율이 투자자에게 주는 의미

5-1. 투자전략상 중요성

비상장주식은 대체로 상장주식보다 유동성이 낮고 가치 산정이 어렵습니다. 따라서 양도 시 투자자에게는 ‘수익실현 타이밍’뿐 아니라 ‘세금부담 구조’가 큰 변수입니다.

세율이 높을수록 실질 수익이 낮아지므로, 양도 시점을 전략적으로 설계할 필요가 있습니다.

5-2. 절세 전략 및 유의사항

  • 중소기업 주식이라면 세율 10% 적용 가능성을 열어두는 것이 절세 측면에서 중요합니다.
  • 보유기간을 1년 이상 확보하는 것이 세율 인하 측면에서 유리합니다.
  • 대주주가 되지 않도록 지분비율 및 시가총액 기준을 사전에 점검하는 것이 좋습니다.
  • 거래 형태가 장외거래인 비상장주식인 만큼 ‘취득가액·필요경비’ 등을 명확히 증빙해 둘 필요가 있습니다.
  • 이런 절세 전략을 사전에 준비해두면 양도 후 세무 부담을 최소화할 수 있습니다.

5-3. 리스크 요인

  • 비상장주식의 가치 산정이 주관적일 수 있어 국세청이 추정가액으로 과세할 가능성 존재
  • 거래 상대가 제한적이므로 양도 시기에 매도 타이밍이 맞지 않을 경우 수익 실현이 지연될 수 있습니다.
  • 지분을 쪼개거나 자문 없이 지분구조를 변경할 경우 ‘대주주 편법’으로 보고 세무조사를 받을 위험이 있습니다.

6. 2025년 변경 예정 또는 유의할 세법 개정사항

  • 최근 조세당국은 비상장주식 거래에 대한 감독을 강화하고 있으며, 신고 누락에 대한 페널티도 엄격해지고 있습니다.
  • 향후 ‘금융투자소득세’ 제도가 확대되는 움직임이 있어 비상장주식 양도세 구조가 변경될 가능성이 제기되고 있습니다. 
  • 중소기업 정의나 벤처기업 요건이 변경되면 ‘세율 10% 적용 여부’가 달라질 수 있으므로 투자 전 최신 법령을 확인해야 합니다.

7. 실전 사례를 통한 비상장주식 양도소득세율 계산 예시

사례 A – 소액주주·중소기업 주식

A씨는 비상장 중소기업 주식을 매입 후 매도하여 양도차익이 1,000만원이 생겼습니다.

  • 소액주주이므로 세율 10% 적용
  • 세액 = 1,000만원 × 10% = 100만원
  • 신고기한 내 신고 완료
  • → 상대적으로 낮은 세율이 적용되어 실질 수익이 더 커졌습니다.

사례 B – 대주주·중소기업 외 주식

B씨는 비상장기업 주식을 지분율 5% 보유(대주주 기준 충족)하고 양도차익 4억원을 실현했습니다.

  • 대주주이므로 과세표준 기준 적용
  • 과표 3억원까지: 20% → 3억원 × 20% = 6,000만원
  • 초과액 1억원: 25% 적용 → 1억원 × 25% = 2,500만원
  • 누진공제나 기타 비용을 고려할 시 실제 세액 산정은 이보다 약간 달라질 수 있습니다.
  • → 대주주인 경우 세율이 크게 높아지므로 지분 유지 전략·양도 타이밍이 중요합니다.

8. 비상장주식 양도소득세율 대응 체크리스트

  • 내 보유한 주식이 상장주식이 아닌 비상장주식인지 확인
  • 본인이 ‘대주주’ 기준(지분율·시가총액)에 해당하는지 점검
  • 보유기간이 1년 이상인지 여부 확인
  • 해당 법인이 ‘중소기업’ 또는 ‘벤처기업’ 요건을 충족하는지 검토
  • 취득가액·필요경비·양도계약서 등 증빙자료 확보
  • 양도 후 반기 말일 기준 2개월 내 신고·납부 일정 체크
  • 향후 세법 개정 여부를 모니터링

9. 비상장주식 양도소득세율 2025, 절세 대응이 관건입니다

비상장주식의 양도차익에 대한 세금 구조는 단순히 ‘이익이 났다 = 세금 내야 한다’ 수준을 넘어, 지분구조·보유기간·기업규모·양도시점까지 복합적으로 작용합니다.

2025년 현재 소액주주라면 비교적 낮은 세율(10% 또는 20%) 적용 가능성이 있고, 대주주라면 과세표준이 커질수록 세율도 높아집니다.

따라서 거래 전 세율 구조 파악, 지분 및 보유기간 전략, 양도 타이밍과 증빙자료 준비를 통해 실질 수익을 지키는 것이 매우 중요합니다.

비상장주식 매도를 고려하신다면 위 내용을 바탕으로 전략을 세워야 한다는 점을 분명히 말씀드립니다.